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所谓微生态制剂，是利用鱼、虾、阳澄湖大闸蟹等动物体内或养殖水体中的有益微生物或促进物质经特殊加工工艺而形成的活菌制剂。

可用于水中微生态调控、净化水质，能产生生物效应或生态效应，也可用于调整或维持动物肠道内微生态平衡，达到防治疾并提供健康水源和促进生长的目的。

市场上常用微生态制剂主要有单一制剂和复合制剂。单一制剂包括枯草芽孢杆菌、蛭弧菌、乳酸菌、酵母菌、光合细菌、硝化细菌、放线菌等;复合微生态制剂包括EM制剂、复合益生菌等